Petrolera Argentina producirá además biodiésel a través de Maikop, también ubicada en Plaza Huincul y que actualmente procesa aguarrás y derivados clorados. Para fines de julio la planta estará en condiciones de producir unas 3.300 toneladas por mes, pero la intención es aumentar en el corto plazo en un 30 ó 40% ese volumen. La inversión realizada, sólo en el revamping de la planta, fue de 1.800.000 dólares.

La materia prima será aceite de soja, provisto por aceiteras de Buenos Aires, Entre Ríos y Santa Fe. El plan contempla abastecer totalmente a Neuquén a través de YPF y el resto de la producción colocarla en Mendoza (YPF) y/o Bahía blanca (Esso y Petrobras). Otro derivado que obtiene en su tarea de refinado es el GLP. Son unas 7.200 toneladas por año de butano-propano.