"Río Negro" ha desarrollado una tarea de investigación importante, creo que no muy común en los medios por la vastedad y la persistencia de nuestras tareas periodísticas durante mucho tiempo. La investigación supone una especialización muy importante por parte de los periodistas, una pasión muy fuerte por la verdad y algo muy vital, que es la credibilidad de lo que uno hace".
Con esta idea del director de este diario, Julio Rajneri, es que se han desarrollado y publicado investigaciones que echaron luz a temas ocultos y ocultados de la realidad regional, nacional e internacional.
Éstas fueron algunas de las investigaciones realizadas por "Río Negro":
- El vaciamiento doloso del Banco Provincia de Río Negro durante las gestiones del ex gobernador Horacio Massaccesi, desarrolladas en las páginas del diario y también en el libro, "Manzanas amargas. El caso Massaccesi", de Julio Rajneri. Recién en setiembre de 2004, 15 años después de las primeras denuncias sobre la llamada "causa grande del Banco", se dictaron condenas en suspenso para Edgar Massaccesi, Francisco Ricciardulli y Rubén Rodríguez.
- Las escandalosas jubilaciones privilegiadas, una investigación que reveló que la ley provincial 2092, sancionada el 14 de julio de 1986 y promulgada el mismo día, consagró un régimen previsional ampliamente generoso para todos los sectores de la administración pública rionegrina pero mucho más para quienes ocuparon cargos electivos en los poderes Ejecutivo y Legislativo.
- La increíble historia de la planta de soda solvay Alpat en San Antonio Oeste y la maniobra que permitió a un grupo de empresarios vinculados a políticos y funcionarios usar durante 30 años dineros del Estado sin ningún control.
- El caso Rocafé, la empresa de un empresario amigo del ex gobernador Pablo Verani pero a nombre de un testaferro, convertida en principal proveedora de alimentos del Estado rionegrino.
- El caso Carrasco, que tomó estado público por este diario, que reveló lo sucedido en Zapala en 1994 con el conscripto del servicio militar hallado muerto allí. "Río Negro" indagó también sobre el escándalo de irregularidades de una investigación destinada a entorpecer el esclarecimiento del crimen que terminó con el servicio militar obligatorio.
- La investigación sobre los casinos y la compleja trama de burocracia, relaciones y coimas durante la gobernación de Pablo Verani en torno del juego administrado por la Lotería estatal en Río Negro. El caso terminó en las condenas a prisión efectiva de Miguel Irigoyen, Carlos Ferrari y Andrés Santamaría.
- El escándalo de las ternas en el Tribunal Superior de Justicia de Neuquén y el intento de soborno al diputado Jorge Taylor por parte del diputado del MPN Osvaldo Ferreyra para colocar jueces funcionales al gobierno provincial de turno. Una cámara oculta registró, en esa oportunidad que el gobernador de entonces Jorge Sobisch habría insinuado la posibilidad de "tener una atención" a favor de Taylor si éste ayudaba a que la Legislatura aprobara una terna de candidatos para el TSJ.
- La compra directa del plan provincial neuquino de seguridad a empresas de propietarios cercanos a Macri. Uno, el presidente de Damovo SA y dirigente de Boca, Manuel Requejo y otro, Cristiano Ratazzi.
- La millonaria estafa al Banco Provincia del Neuquén en relación al caso Temux, durante la gobernación de Sobisch.
- La revelación de los campos de La Pampa atribuidos a Luis Manganaro, ex titular del BPN.
- Todo lo que no se profundizó en la investigación sobre los atentados a la AMIA y la embajada de Israel en Buenos Aires: "la pista siria", ahora tomada en cuenta.
- La red de contrabando y cultivo de drogas en la Triple Frontera, con crudos testimonios e imágenes.
- Las maniobras de coimas que involucraron a altos funcionarios menemistas y radicales y a empresarios, sindicalistas y banqueros españoles e italianos.
En oportunidad de presentarse el registro de algunos de estos trabajos en el libro "Las investigaciones", en el 2003, Rajneri sostuvo que "una cuestión en las relaciones del Poder Judicial con el periodismo es el eco que las investigaciones que realizan los medios tienen en la justicia. Sin la participación de la justicia, sin la labor que realiza el Poder Judicial el periodismo funciona en el vacío".