Es un gran desafío asegurar que el manejo de las pesquerías sea responsable en cuanto a la conservación de naturaleza, de la que el turismo, la pesca y las comunidades costeras de la Patagonia dependen en gran parte, conservando -al mismo tiempo- la actividad económica, los ecosistemas marinos y el trabajo todos aquellos que viven del mar y sus recursos.

La voluntad de avanzar en forma sostenida en el manejo sustentable de los recursos pesqueros demostrada con por ejemplo la implementación del Sistema de Monitoreo Pesquero y Oceanográfico (SIMPO) que la empresa argentina INVAP desarrolló para la Provincia en el 2004 han captado la atención y el apoyo económico de organizaciones internacionales vinculadas a la conservación y al cuidado del medio ambiente. Entre ellas, el Fondo Mundial para la Naturaleza (WWF), el Consejo de Administración Marina (MSC por sus siglas en inglés) y la Resources Legacy Fund (RLF).

En el 2003, FVSA comenzó a trabajar junto a las autoridades de Río Negro, el IBMP Alte. Storni y actores locales, en el desarrollo de planes de manejo sustentable y procesos de certificación.